Pastāvīgo preparātu
pagatavošana augu anatomijā
LU Bioloģijas
fakultāte
III kurss
Brigita Javoiša
2006
Referātu saraksts
Saturs
uz augšu
Auga daļu pastāvīgo preparātu
pagatavošana ir sarežģītāka, ja salīdzina ar pagaidu preparātu
gatavošanu, jo prasa daudz laika, lielāku rūpību utt. Atšķirībā no
pagaidu preparātiem, pastāvīgos uzglabā ilgu laiku, griezumiem jābūt
teicamas kvalitātes, tādēļ pastāvīgo preparātu gatavošanai izmanto ar
mikrotomu grieztus griezumus (Kondratovičs 1976).
uz augšu
Ar ķīmisko fiksatoru palīdzību tiek
fiksēti atsevišķi šūnas komponenti(piem., mitohondriji, kodoli,
hromosomas), kas pastāvīgā preparāta sagatavošanas gaitā citādi netiktu
saglabāti.
Ķīmisko fiksatoru shēmas un sastāvs ir ļoti daudzveidīgi, to izvēle ir paša pētnieka ziņā un atkarīga no konkrētā eksperimenta mērķiem. Biežāk izmantotais ir FAA fiksators (sastāvs : etanols, ledus etiķskābe, formalīns, destilēts ūdens). Tiek izmantoti arī FPA, Navašina, Karnua, Levicka fiksatori.
Fiksatoram jābūt svaigi gatavotam, tas nedrīkst būt silts. Fiksējamo materiālu jāsadala nelielos gabalos, lai tas ātrāk infiltrētos ar fiksatoru.
Fiksācijas laiks var būt ļoti
atšķirīgs
un ir atkarīgs no pētījuma mērķa no 1 h līdz vairākām dienām.
uz augšu
Pēc fiksēšanas materiālu parasti skalo
tekošā ūdenī (ja tas ir fiksators ūdens šķīdumā) vai spirtā (fiksators
spirta šķīdumā). Šī procesa ilgums arī var būt dažāds no 1
h līdz 48 h.
Tā kā cietinošā vide (piemēram, parafīns), kurā materiāls tiks ieslēgts pirms mikrotomēšanas, ir hidrofoba, tad audi ir pilnīgi jāatūdeņo (dehidrē), jo pretējā gadījumā parafīna infiltrācija audos nebūs iespējama un rezultātā var rasties pētāmo struktūru uzbūves artifakti.
Parasti atūdeņošanai izmanto etanolu.
Šeit
jāpiebilst, ka lielākā daļa
atūdeņošanas šķīdinātāju pēc savas ķīmiskās dabas nav tas pats, kas
parafīna šķīdinātāji, tādējādi pēc dehidrēšanas vēl ieteicams
iekļaut(ja
līdzekļi to atļauj) starpposms, kad materiālu pārvieto no dehidrējošā
šķīdinātāja parafīna šķīdinātājā (Ruzin 1999). Kā parafīna šķīdinātāji
minami
ksilols (plašāk pieejams),
Histo-Clear TM,34, izopropanols, terc-butanols jeb TBA (dārgāki,
ekskluzīvāki). Pēdējie divi tomēr ir salīdzinoši mazāk toksiski un
vieglāk
pielietojami (Ruzin 1999).
Lai no augu materiāla varētu pagatavot plānus griezumus, tas jāieslēdz blīvā vidē (parafīns vai sintētiskie materiāli). Sākotnēji šīs vides ir šķidrā veidā, lai lēnā difūzijas ceļā iespiestos audos (tos infiltrētu) un pēc tam sacietētu.
Šajā posmā parafīna šķīdinātājs tiek aizvietots ar šķidru parafīnu (vai sintētisko materiālu). Ir ļoti svarīgi, lai infiltrācija noritētu pakāpeniski un pilnīgi pretējā gadījumā nepilnīga šķīdinātāja nomaiņa ar parafīnu būs par iemeslu neveiksmēm mikrotomēšanas procesā (Ruzin 1999).
Bez tradicionālā parafīna tiek
lietotas vēl arī
citas, alternatīvas, cietinošās vides, kas gan ir salīdzinoši dārgākas
un paredzētas
sarežģītākiem eksperimentiem. Tās ir : poliēstera vasks,
karbovasks,
celoidīns, metakrilāts, Paraplast RX-tra, Technovit sveķi
u.c. No šadās vidēs cietinātiem audiem iespējams iegūt pat 0,5-3 mikrometrus biezu griezumu (Ruzin
1999).
Piemēram, "Technovit" cietinošie sveķi (alternatīva cietinošā vide) ir
polimērs, kurš spēj stabilizēt audu struktūru tik stipri, ka iespējams
iegūt pat 1 mikrometru biezu griezumu (Takechi et al., 1999).
Cietināšanu veic papīra kārbiņās vai speciālās metāla veidnītēs.
Materiāla infiltrācijai un
sekojošai
ieslēgšanai cietinošā vidē var tikt izmantotas speciālas mikroviļņu
aparatūras (krāsnis), kas visu preparāta pagatavošanas laiku saīsina
līdz pat 4 h (Schichnes et al 1999).
uz augšu
Cietinātie audi tiek griezti ar
mikrotoma palīdzību. Ir divu veidu mikrotomi slīdes un rotācijas,
kas atšķiras ar to, ka slīdes mikrotomā
bloks ar paraugu ir novietots stacionāri, kamēr mikrotoma nazis griež
horizontālā plaknē, savukārt rotācijas mikrotomā stacionāri novietots
ir nazis un pret tā malu tiek pārvietots bloks ar ieslēgto paraugu.
Slīdes mikrotomu
izmanto, ja griežami
lieli paraugi.
Iegūtos griezumus kārto uz priekšmetstikliem(tīriem!), iepriekš tos apstrādājot vai nu ar kādu speciālu līmvielu (adhezīvu) vai vienkārši ar olas baltuma un glicerīna šķīdumu (1:1).
Attēlā pa kreisi : slīdes
mikrotoms Leica
SM2500. Foto :
http://www.leica-microsystems.com/website/lms.nsf?opendatabase&path=/website/products.nsf/(ALLIDs)/DAA4E65F6EB18584C1256AEE003B456B
Attēlā pa labi : rotācijas
mikrotoms Leica RM2245. Foto :
http://www.leica-microsystems.com/website/lms.nsf?opendatabase&path=/WebSite/products.nsf/(ALLIDs)/CC28848810E54B4F41256AB500530D5F
uz augšu
Parasti parafīns pirms krāsošanas tiek
šķīdināts ar ksilolu.
Ir izstrādātas metodes, kad tradicionālo metodi vienkāršo, griezumus
krāsojot bez parafīna noņemšanas (Xi et al. 1997).
Pēc parafīna izšķīdināšanas (deparafinēšanas) priekšmetstikli ar griezumiem tiek pārvietoti vispirms uz etanola:ksilola šķīdumu, pēc tam uz etanola šķīdumiem ar pakāpeniski samazinošos koncentrāciju (Ruzin 1999).
Krāsošanai parasti izmanto ūdens šķīduma krāsvielas.
Ir zināmas simtiem krāsošanas shēmu un metožu, un tās izvēlas atkarībā no izpētes mērķa. Krāsošanas metode var būt progresīva vai regresīva. Pēc progresīvās metodes preparātu krāso sākumā ar vājākas koncentrācijas krāsvielas šķīdumu, pārbaudot nokrāsošanās pakāpi mikroskopā. Tiklīdz šūnas struktūras sasniedz vajadzīgo krāsojumu, lieko krāsu noskalo (Kondratovičs 1976).
Pēc regresīvās metodes preparātus uzreiz krāso ar stipras koncentrācijas krāsvielu, bet pēc tam veic diferenciāciju, t.i., lieko krāsu izskalo ar šķīdinātāju, pārbaudot diferenciācijas pakāpi mikroskopā (Ruzin 1999).
Biežāk izmantotās krāsvielas augu anatomijā ir Safranīns (atkarībā no lignifikācijas pakāpes šūnapvalki krāsojas sarkanā līdz zilā krāsā), Anilīna zilais (sinonīmi : Jūras zilais, Katūna zilais kallozes krāsošanai), Ātrais zaļais jeb Fast green (kā papildus krāsviela pēc Safranīna).
Krāsošanas procesa ilgums variē
atkarībā no izvēlētās krāsošanas shēmas, parasti tās ir ~2-3 min.
Ir aprakstītas metodes,
kad tiek mēģināts vienkāršot tradicionālo parafinēšanas metodi,
griezumus krāsojot vēl pirms parafīna ekstrakcijas
(deparafinēšanas) ar Toluidīna zilo krāsvielu (Xi et al. 1997).
uz augšu
Lai iegūtos preparātus sagatavotu
uzglabāšanai ilgākam laikam kā pastāvīgos preparātus, pēc krāsošanas
tos atkārtoti ir jāatbrīvo no ūdens (dehidrē). To panāk, ūdeni
saistītāju-vielu etilspirtu (pieaugošās koncentrācijās) pakāpeniski
aizstājot vispirms ar etilspirta-ksilola šķīdumu, bet beigās ar tīru
ksilolu.
Šādi sagatavotus priekšmetstiklus pārsedz ar segstikliņiem, kā cementējošo vielu izmantojot Kanādas balzamu ( kas nodrošina ilgstošu uzglabāšanu un nepieciešamās optiskās vides īpašības). Kā Kanādas balzama aizstājēji varētu tikt izmantoti arī Permount, Merkoglas (dārgi) u.c.
Saulgriezes Helianthus
annuus stumbra
šķērsgriezums, pastāvīgais preparāts. Pagatavots pēc tradicionālās
parafinēšanas metodes, griezums iegūts, izmantojot rotācijas mikrotomu
Leica RM 2145 (Leica Microsystems GmbH), griezuma biezums 10
mikrometri.
Foto : B.Javoiša
Saulgriezes Helianthus
annuus stumbra
šķērsgriezums, pastāvīgais preparāts. Pagatavots pēc tradicionālās
parafinēšanas metodes, griezums iegūts, izmantojot rotācijas mikrotomu
Leica RM 2145 (Leica Microsystems GmbH), griezuma biezums 12
mikrometri.
Foto : B.Javoiša
Izmantotā literatūra :
Kondratovičs R. 1976 - Augu
anatomijas praktikums. Rīga, Izdevniecība "Zvaigzne" , 280 lpp.
Ruzin S.E. 1999 - Plant
microtechnique and microscopy. New York Oxford, Oxford University
Press, pp.307
Schichnes D., Nemson J.,
Sohlberg L., Ruzin S.E. 1999 -Microwawe protocols for paraffin
microtechnique and in situ localization in plants. Microscopy and
Microanalysis 4 : 491-496
Takechi K., Sakamoto W.,
Katsuhara M., Murata M., Motoyoshi F 1999 - In situ RNA hybridization
using Technovit resin in Arabidopsis
thaliana. Plant Molecular Biology Reporter, 17 : 43-51
Xi K., Burnett P.A. 1997 -
Staining paraffin embedded dections of scald of barley before paraffin
removal. Biotechnic&Histochemistry, 72(4) : 173-177
Norādes uz citiem
serveriem :
https://kb.osu.edu/dspace/bitstream/1811/3382/1/V44N01_036.pdf
izstrādāta speciāla metode
vārpatas lapas šķērsgriezuma preparāt pagatavošanai. Vārpatas lapas
satur salīdzinoši daudz silīcija savienojumu, kas iepriekš jāšķīdina,
lai krāsviela efektīvi varētu infiltrēt audus.
http://www.zoo.utoronto.ca/able/volumes/vol-19/9-yeung.pdf
vienkāršas metodes augu
materiāla sagatavošanai mikroskopiskai izpētei, neizmantojot mikrotomu,
bet gan griešanu ar žileti.
http://dev.biologists.org/cgi/reprint/120/9/2465.pdf
molekulāri-bioloģisks
pētījums : Arabidopsis
thaliana saknes
epidermas post-embrionālā attīstība. Tiek veikta arī saknes epidermas
šūnu struktūru anatomiska izpēte, griezumus pagatavojot gan ar
rotācijas, gan ar sekvenciālā mikrotoma palīdzību
http://www.fpl.fs.fed.us/documnts/fplrn/fplrn056.pdf
metode satrunējušas koksnes
vai tamlīdzīga drupana, irdena materiāla sagatavošanai anatomiskiem
pētījumiem
http://www.tamu.edu/mic/Protocols/Steedman_wax.pdf
anatomiskie griezumi tiek
izmantoti arī auga imūncitoloģiskos pētījumos, lai noteiktu dažādus
antigēnus, šajā gadījumā cietinošā vide ir īpaši poliēstera sveķi,
kuriem ir vairākas priekšrocības, salīdzinot ar parafīnu.
http://ajevonline.org/cgi/content/abstract/55/3/238
koksnaina augu materiāla (Vitis vinifera Cv.Chardonnay) preparāta
pagatavošanas metode.